數學方法在計算分子生物學中的套用

數學方法在計算分子生物學中的套用

《數學方法在計算分子生物學中的套用》是依託大連理工大學,由王天明擔任醒目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:數學方法在計算分子生物學中的套用
  • 依託單位:大連理工大學
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:王天明
  • 批准號:10571019
  • 申請代碼:A0604
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2006-01-01 至 2008-12-31
  • 支持經費:24(萬元)
項目摘要
計算分子生物學作為數學、計算機科學、化學等多學科交叉形成的一門嶄新的學科,主要是研究分子生物學中基因和蛋白質序列有關的複雜計算問題。所使用的數學工具有組合數學、組合最佳化、數理統計等。我們將在RNA二級結構組合計數、生物序列的相似性分析和比較、基因識別、種族樹的構建等方面進行研究:運用Bell 多項式和反演技術考慮不帶假結的RNA二級結構計數,並建立它與格路之間的關係,將結構量化,尋求新的數學理論;進而利用分拆理論考慮帶假結二級結構的最小自由能和結構預測;給出DNA序列和RNA二級結構合理的幾何圖形表示,並探索生物序列數據特徵的生物學意義;利用數值特徵比較DNA序列和RNA二級結構的相似性,將相似性轉化為距離記分構建進化樹;構建更加有效的基因識別的最佳化模型,提高處理龐大數據量時的可靠性;給定一組基因在不同條件下表達水平的數據,對基因間是否存在相互協同作用及相互作用的強度做出統計推斷。

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