序列聯配(sequence alignment)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
基本介紹
- 中文名:序列聯配
- 外文名:sequence alignment
- 所屬學科:計算機科學技術
- 公布時間:2018年
序列聯配(sequence alignment)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
序列聯配(sequence alignment)是2018年公布的計算機科學技術名詞。定義研究和比對兩條(或多條)DNA、RNA或蛋白質序列的排列方式以發現序列中的相似區域,這些相似區域通常和功能、結構或者進化相關聯。出...
聯配是根據兩個或多個的核苷酸序列的重合部分,找出這些序列中結構或功能相似性區域。基於計算機編程的多序列聯配技術在中藥研究中的套用 從七個方面概述了生物信息學多序列聯配技術在中藥研究中的套用,包括:中藥功能基因的快速篩選與鑑定,中藥資源的分子鑑定與本草考證,中藥新資源的發現,中藥蛋白成分的結構與功能預測,...
《生物序列分析》是2010年科學出版社出版的圖書,作者是Richard Durbin。內容簡介 《生物序列分析》在結構上大致可以分為四個部分,每個部分所覆蓋的問題分別是:二序列聯配、多序列聯配、系統發育樹和RNA結構,具體分為:二序列聯配、Markov鏈與隱馬模型、使用HMM的二序列聯配、朋於序列家族的列型HMM、多序列聯配...
第6章基於隱馬爾可夫模型和QPSO算法的多序列比對167 6.1引言167 6.2隱馬爾可夫模型168 6.2.1隱馬爾可夫模型的基本原理168 6.2.2隱馬爾可夫模型的基本問題與算法169 6.3基於剖面HMM和QPSO的多序列比對172 6.3.1融合多樣性的QPSO算法174 6.3.2評估訓練算法的質量179 6.3.3模型的聯配問題179 6.3.4評估...
第三節 兩條序列聯配算法 一、Needleman-Wunsch算法 二、Smith-WaterTnan算法 第四節 BLAST算法及資料庫搜尋 一、BLAST算法 二、利用BLAST 進行資料庫序列搜尋 三、序列相似性的統計推斷 第1-4章 多條序列聯配算法及功能域分析 第一節 多序列聯配概念及其算法 一、多序列聯配概念 二、多序列全局聯配算法 三...
一、序列的同源性和相似性71 二、PAM和BLOSUM計分矩陣72 三、動態規划算法75 四、資料庫搜尋的FASTA和BLAST算法77 第二節 多序列聯配79 一、多序列聯配的概念79 二、多序列聯配常用的ClustalW算法80 三、多序列聯配結果的表示和資料庫搜尋81 第三節 隱馬氏模型84 一、馬爾可夫鏈85 二、隱馬氏模型的形式86...
6.7 得分聯配 6.8 局部序列聯配 6.9 缺口罰分聯配 6.10 多重聯配 6.11 基因預測 6.12 基因預測的統計方法 6.13 基於相似性的基因預測方法 6.14 剪接聯配 6.15 附註 人物天地:Michael Waterman 6.1 6 問題 7 分而治之算法 7.1 排序問題的分治法 7.2 空間效率高的序列聯配 7.3 模序聯配...
F 多序列聯配:基因和蛋白質家族 F1 多序列聯配和家族關係 F2 蛋白質家族和模式資料庫 F3 蛋白質結構域家族 G 系統發育學 G1 系統發育學、遺傳分類學和存在論 G2 構建系統發育樹 G3 大分子序列進化 H 序列注釋 H1 基因組注釋原理 H2 注釋工具和資源 I 結構信息學 I1 蛋白質結構的概念模型 I2 蛋白質...