山東省生物物理重點實驗室

生物物理實驗室始於1996年依託德州師專時期成立的生物信息學實驗室,二十餘年來,先後經歷了學校、德州市和山東省高校、山東省省市共建等重點實驗室的建設發展歷程,2015年8月經過省科技廳考核驗收被批准為省級重點實驗室。以該實驗室為支撐,相繼獲批山東省生物物理重點學科、山東省生物物理實驗教學示範中心等省級平台。

基本介紹

  • 中文名:山東省生物物理重點實驗室
  • 機構地址:山東省德州市德城區大學西路566號
  • 郵政編碼:253023
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發展歷史

1996年,在德州師專成立“生物信息學實驗室”。承擔了第一項山東省自然科學基金課題“DNA序列運作規律的數理研究”(Y95D1356),在Journal of Theoretical Biology 發表“Study on the Isentropic Equations of Nucleotide Sequences and Their Application”論文。
2004年,成立德州學院“生物物理重點實驗室”,完成山東省科技攻關課題“複合生物物理等技術促進淡水魚生長及其機理的研究”。
2005年,成為“德州市生物物理重點實驗室”。與南京大學和中國科技大學聯合承擔國家自然科學基金重點課題“蛋白質和酶的摺疊機制與其功能相關動力學”。
2006年,成為“山東省高校生物物理重點實驗室(籌)”,成立了由院士領銜的第一屆學術委員會。
2008年順利通過教育廳籌建階段的驗收。
2009年,獲批為山東省首批研究生聯合培養基地,與山東師範大學聯合招收了首屆生物物理方向碩士研究生。
2010年,獲批“山東省功能大分子生物物理重點實驗室(省市共建培育基地)”立項建設,被評為“德州市首席專家崗位”,依託該平台獲批“山東省生物物理重點學科”。研究成果“生物分子的物理特性研究”獲山東省自然科學三等獎,是德州市首次獲得該獎項。三年後,順利通過山東省科技廳組織專家對省市共建培育基地的驗收。
2012年,獲批“山東省生物物理實驗教學示範中心”、“山東省高校生物物理首席專家崗位”。依託該實驗室,成立了“山東省物理學會生物物理專業委員會”。
2013年,成立了“德州市生物物理技術與生物製造協同創新中心”。組建了施蘊渝院士和陳潤生院士為主任的實驗室新一屆學術委員會。聘任印第安納大學教授周耀旗博士為實驗室特聘教授。
2014年,組織召開了“德州2014生物物理技術協同創新論壇”,實驗室特聘教授周耀旗博士入選山東省泰山學者海外特聘教授。
2015年,獲批山東省生物物理省級重點實驗室立項建設,成為山東省開展生物物理多學科交叉研究的重要平台。
2016年,成立了“中國生物物理學會德州國家生物產業基地協同創新中心”。同年,實驗室宋峰博士獲批泰山學者青年專家。
2017年,實驗室科研團隊獲批山東省黃大年生物物理創新團隊, 打造了一支山東省開展BIO-X大交叉研究的重要團隊。
2018年,楊躍東教授被評為“天衢英才”特聘教授。

科研平台

生物大分子模擬與生物信息平台
曙光高性能計算機集群
曙光GPU工作站(3套)
曙光生物信息學伺服器系統
分子細胞生化平台
Thermo多功能酶標儀器
Thermo磁珠純化提取儀
Stratagene實時螢光定量PCR儀
貝克曼超速離心機
Alpha凝膠成像系統
日立螢光分光光度計
生物感測及生物分子信息檢測平台
石墨烯生長系統
磁控濺射系統
原子力顯微鏡
鈦寶石飛秒雷射器
拉曼光譜儀器
半導體參數分析儀
光刻機
探針台
基於物理刺激的生物技術及套用平台
低能離子束注入系統
細胞組織力學載入系統
掃描電子顯微鏡
Leica雷射共聚焦顯微鏡
FACSCalibur流式細胞儀
高效液相層析系統
350升中試純水系統
50升微生物中試發酵系統

科研內容

方向1: 生物大分子模擬及藥物設計
1. 研究蛋白質、非編碼RNA及DNA等生物大分子及其組成複合體的動力學性質;
2. 分析藥物小分子與蛋白質和RNA的相互作用,設計更有效的藥物小分子等;
3. 研究細胞穿膜肽的跨膜機制、抗菌肽的抗菌機制,引導肽藥設計;
4. 與冷凍電鏡實驗技術相結合,分析結構性質,並發展提高其解析度的新方法。
方向 2: 高通量生物大數據分析技術
1. 針對各種組學數據及序列結構信息,發展有效分析方法,開發計算軟體或線上平台,為生物醫療數據分析提供有效工具;
2. 深入研究LncRNA、固有無序蛋白等重要生物分子相關序列結構特徵及生物作用機制,發展預測方法,開發特色資料庫資源,為相關實驗研究提供可靠理論依據和技術支持;
3. 針對野生小麥、黃傘菌等真核、原核生物,識別、鑑定重要功能基因,揭示功能機理,為實驗室相關生物資源開發提供理論依據。
方向 3: 納米生物感測信息檢測技術
1. 開展基於石墨烯等納米材料的生物感測技術研究,利用多種物理、化學方法製備石墨烯、金屬納米顆粒等感測材料,利用飛秒雷射刻蝕、光刻等工藝製作多種類型的納米感測器件,通過化學修飾、生物組裝等方法裝配酶、抗體、抗原、適配體等探針,研製高靈敏、高選擇性的納米生物感測器
2. 基於納米生物感測器開展對多類生物分子濃度、親和力、動力學常數的檢測研究,對疾病相關重要生物分子進行痕量分析,研究某些生命活動的內在分子機制,為重大疾病早期診斷及治療提供依據。同時,基於納米生物感測器發展藥物篩選、環境監測、農殘檢測、食品安全檢測等新技術。
方向4: 離子束誘變生物技術及套用
1. 以食藥兼用真菌黃傘菌的系統開發研究為內容,利用生物信息學手段分析基因組、轉錄組及代謝組等組學信息以進行黃傘品種的分子鑑定,為黃傘的工廠化生產和開發提供理論依據;黃傘功能活性物質(如黃傘多糖、多肽)的提取純化工藝研究,最終為天然黃傘用於保健品新產品開發奠定基礎;
2. 利用結構生物學手段解析病原微生物(如結核分枝桿菌)中與其致病性相關的蛋白複合物的三維結構,結合分子生物學、微生物學等手段闡明相關病原微生物的致病機制,為開發新型抗菌藥物提供結構參考;
3. 針對農業生產中土傳病害如根腐病、褐斑病等嚴重影響農產品產量和品質的問題,開展土傳病害拮抗菌的篩選、鑑定及其微生物肥料的研發工作,並利用離子束輻照等手段對篩選得到的菌種進行最佳化改良。

科研成就

近幾年實驗室成員在lncRNA特徵挖掘及資料庫建設、石墨烯納米生物感測技術方面取得重大突破,在Nature Communications、Nucleic Acids Research等國內外核心期刊發表研究論文200餘篇,其中SCI收錄論文150餘篇;獲山東省自然科學三等獎1項,山東省科技進步三等獎1項,山東省發明創業二等獎1項,山東省青年科技獎1項,山東省級教學成果一等獎和二等獎各1項,山東省高校優秀科研成果獎10餘項;主持承擔國家級和省部級科研課題40餘項。
生物物理研究院李強博士申報的“納米生物膜交叉創新團隊 ”(基於生物防禦素的功能複合型聚電解質基反滲透膜研製)獲批山東省高等學校優秀青年創新團隊支持計畫立項。

人才培養

交叉人才培養:
依託生物物理重點實驗室,支撐生命科學院、物理與電子信息學院等十餘個專業的建設和人才培養,其中物聯網工程專業群獲批省重點培育專業群,獲批建設經費1000萬元,每年有30名本科生進入實驗室從事科研訓練,近年來已在國內外核心期刊發表研究論文多篇,獲批山東省優秀學士論文多篇,本科生考研率50%以上。
經多方調研、論證,校長辦公會討論通過,同意依託生物物理重點實驗室,成立德州學院智慧型生物醫療技術實驗班,面向生命學院、物理學院、計算機學院的十餘個本科專業,每年從大二開始招收20-30名優秀本科生,面向新興生命科學和大健康交叉產業行業,培養學生交叉創新能力,打造我省多學科交叉人才培養基地。
研究生培養:
依託重點實驗室,於2009年獲批了山東省研究生培養基地。近年來,發揮實驗室多學科交叉優勢,已與山東師範大學聯合培養研究生29名,在國內外核心期刊發表研究論文20餘篇。

機構領導

實驗室主任:王吉華
副主任:於家峰 曾強成 劉漢平 扈國棟

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