《天然產物生物合成：化學原理與酶學機制》是2020年化學工業出版社出版的圖書。
基本介紹
- 中文名：天然產物生物合成：化學原理與酶學機制
- 作者：[美]克里斯托弗，T.沃爾什（Christopher，T.，Walsh）
- 出版社：化學工業出版社
- 出版時間：2020年10月1日
- ISBN：9787122369413
內容簡介,圖書目錄,
內容簡介
《天然產物生物合成：化學原理與酶學機制》首先概述了天然產物的主要類別，然後詳細討論了六種不同類別天然產物形成的化學邏輯，並介紹了天然產物生物合成途徑中關鍵酶的結構生物學、功能和機制，最後對基因組依賴和非基因組依賴的天然產物發現的主要方法進行了總結和討論。本書作者是國際上天然產物生物合成領域的學者，圖書內容豐富，對學科發展的把握和領悟比較準確。本書的信息量非常大，對於那些有興趣更好地理解天然產物是如何由簡單的初級代謝合成砌塊組裝而成的高年級本科生、研究生和科研人員來說，它都是一本必不可少的教材和工具書。
圖書目錄
第Ⅰ部分 天然產物簡介
第1章 天然產物骨架的主要類型及生物合成酶學機制003
1.1 引言 003
1.2 初級代謝和次級代謝產物 006
1.3 聚酮類天然產物 008
1.4 肽類天然產物 010
1.5 異戊二烯/萜類天然產物 014
1.6 生物鹼 017
1.7 含嘌呤和嘧啶的天然產物 021
1.8 苯丙素 021
1.9 糖基化的天然產物 022
1.10 天然產物骨架的多樣性來自有限的合成砌塊和有限的酶家族 026
1.11 次級代謝途徑中一些值得注意的和不尋常的轉化 028
1.12 廣泛存在於天然產物生物合成途徑中的加氧酶 029
1.13 天然產物生物合成中的碳-碳鍵 030
1.14 同位素標記實驗驗證生物合成假說 034
1.15 對天然產物檢測和表征的方法 036
1.16 小結：不同類型的天然產物具有不同的組裝原理 038
1.17 卷尾 038
參考文獻 039
第Ⅱ部分 六類天然產物
第2章 聚酮類天然產物045
2.1 引言 045
2.2 聚酮類化合物具有多種多樣的骨架結構和治療價值 047
2.3 作為脂肪酸和聚酮類化合物合成砌塊的乙醯輔酶A、丙二酸單醯輔酶A及丙二酸單醯-S-醯基載體蛋白 048
2.4 脂肪酸生物合成原理及酶學機制適用於聚酮合酶 050
2.5 聚酮合酶（PKS） 053
2.6 主要聚酮結構的生物合成 058
2.7 聚酮合酶裝配線上或線下經[4+2]環化而成的聚酮類化合物：協同進行還是逐步進行？ 065
2.8 多烯亞類的聚酮化合物 076
2.9 源自聚酮的聚醚類代謝產物 079
2.10 聚酮與其他天然產物在合成途徑上的融合 084
2.11 裝配線下的後修飾酶 087
參考文獻 088
第3章 多肽來源的天然產物095
3.1 引言 095
3.2 核糖體與非核糖體胺基酸的寡聚特性 098
3.3 使新生蛋白具有變形緊湊骨架的翻譯後修飾：RIPPs 100
3.4 非核糖體肽合成酶裝配線：形成高度變形肽骨架的替代途徑 117
3.5 非蛋白源胺基酸合成砌塊 118
3.6 NRPS裝配線原理：啟動、起始、延伸、終止 123
3.7 NRPS終止步驟中的不同鏈釋放方式 126
3.8 NRPS裝配線的結構特徵 130
3.9 肽鏈的裝配線前、裝配線上以及裝配線下修飾 132
3.10 NRP-PK雜合體：機制和實例 133
3.11 小結 141
參考文獻 142
第4章 異戊二烯類/萜類147
4.1 基於異戊二烯的骨架結構蘊含種類最豐富的天然產物 147
4.2 2-及3-異戊二烯基焦磷酸是生物體中用於頭-尾式烷烴鏈延伸的異戊二烯合成砌塊 148
4.3 長鏈異戊烯基焦磷酸骨架 150
4.4 合成IPP異構體的兩條途徑：經典及非經典途徑 152
4.5 兩分子2-IPP間的自縮合形成菊醯基環丙基骨架 155
4.6 碳正離子引發的骨架重排及淬滅 156
4.7 頭-頭及頭-尾模式的烷基化偶聯：C30和C40萜類化合物 164
4.8 角鯊烯2,3-氧化物及環化的三萜 167
4.9 由八氫番茄紅素生成胡蘿蔔素和維生素A 182
4.10 異戊二烯類與其他類天然產物之間的反應 187
4.11 由焦磷酸香葉酯生成裂環馬錢素：異胡豆苷及上千種生物鹼的前體 191
參考文獻 194
第5章 生物鹼199
5.1 引言 199
5.2 生物鹼家族的分類 200
5.3 生物鹼生物合成途徑中常見的酶促反應 202
5.4 三種芳香胺基酸用作生物鹼的合成砌塊 207
5.5 色氨酸用作生物鹼的合成砌塊 218
5.6 以鄰氨基苯甲酸作為起始和延伸單元用於構建真菌肽基生物鹼的複雜性 226
5.7 由色氨酸生成吲哚並咔唑類生物鹼 233
5.8 由色氨酸氧化二聚化形成terrequinone 236
5.9 其他生物鹼：甾體生物鹼 237
5.10 小結 240
參考文獻 241
第6章 嘌呤和嘧啶衍生的天然產物245
6.1 引言 245
6.2 DNA和RNA中各嘌呤和嘧啶間的配對 246
6.3 RNA世界的遺蹟 249
6.4 嘌呤和嘧啶的經典生物合成路徑 250
6.5 咖啡因、可可鹼和茶鹼 252
6.6 植物異戊烯基腺嘌呤：細胞分裂素 253
6.7 核糖核苷酸的成熟及嘌呤和嘧啶天然產物的修飾 254
6.8 肽基核苷 261
6.9 小結 269
參考文獻 270
第7章 苯丙素類天然產物的生物合成275
7.1 引言 275
7.2 由苯丙氨酸生成對香豆醯輔酶A 277
7.3 單木質醇、木脂素和木質素的生物合成 281
7.4 從對香豆醯輔酶A到所有其他類型苯丙素 290
7.5 從查爾酮到黃烷酮類化合物等 296
7.6 肉桂酸來源的苯丙素類 305
7.7 最後留意一種不同的苯丙素途徑：酪氨酸作為質體醌和生育酚類的前體 310
7.8 小結 313
參考文獻 314
第8章 吲哚萜類：生物鹼Ⅱ319
8.1 引言 319
8.2 由色氨酸生成三環骨架的兩條途徑：β-咔啉和吡咯並吲哚 319
8.3 以Trp-Xaa二酮哌嗪NRPS裝配線產物為底物的區域選擇性異戊烯基化 322
8.4 吲哚環上的七個親核位點：豐富的可能性 325
8.5 真菌中由DKP產生色氨酸來源的生物鹼 329
8.6 細菌中五環吲哚咔唑類化合物的形成 335
8.7 長春鹼類化合物：從異胡豆苷到水甘草鹼再到文多靈 337
8.8 鞘絲藻毒素：單一生物合成途徑中吲哚環上的單電子和雙電子反應模式 339
8.9 由色氨酸生成環匹阿尼酸 343
8.10 小結 346
參考文獻 346
第Ⅲ部分 天然產物生物合成途徑中的關鍵酶
第9章 天然產物碳-碳鍵形成中的碳自由基353
A.加氧酶
B.氧依賴型鹵代酶
9.1 引言 353
9.2 初級代謝與次級代謝中的加氧酶 355
9.3 氧化酶與加氧酶 358
9.4 加氧酶中的有機和無機輔因子 361
9.5 鐵依賴的加氧酶和黃素依賴的加氧酶催化的加氧反應的範疇與機制 363
9.6 特定天然產物途徑中的加氧酶 370
9.7 碳自由基與羥基自由基捕獲的解偶聯：天然產物生物合成中鐵依賴酶的次要還是核心目的？ 381
9.8 氧依賴型鹵代酶 389
9.9 底物氟化的非氧化途徑：氟化酶 397
9.10 小結：高價鐵（高價鐵氧物種）反應中間體的化學多功能性 397
參考文獻 399
第10章 S-腺苷甲硫氨酸：生物合成中單電子和雙電子反應形式407
10.1 引言 407
10.2 SAM的有氧自由基化學反應 411
10.3 SAM的厭氧自由基化學反應 415
10.4 自由基SAM酶的反應範疇 419
10.5 SAM用作輔酶 422
10.6 SAM作為可消耗的底物：無甲基轉移 425
10.7 惰性碳中心的甲基化：消耗兩分子SAM生成兩組不同的產物 433
10.8 SAM的反應性和功能總結 439
參考文獻 440
第11章 低聚糖和糖苷類天然產物445
11.1 引言 445
11.2 葡萄糖是初級代謝中主要的己糖 452
11.3 糖基化天然產物的展示 461
11.4 NDP-葡萄糖轉變為NDP-修飾己糖的化學邏輯 467
11.5 糖基轉移酶與糖苷酶的平衡：氰苷和硫代葡萄糖苷 474
11.6 氨基糖苷類：沒有苷元的寡糖 480
11.7 卡那黴素、妥布黴素、新黴素 481
11.8 鏈黴素 483
11.9 默諾黴素類 484
11.10 小結 488
參考文獻 488
第Ⅳ部分 基因組非依賴性和基因組依賴性的天然產物發現
第12章 天然產物的分離和表征：不依賴基因的方法 493
12.1 引言 493
12.2 天然產物分離方法的歷史和現狀 493
12.3 特定天然產物的分離和表征 496
12.4 研究實例：歷史與現狀 499
12.5 五種植物來源的天然產物 500
12.6 三種微生物代謝產物 508
12.7 天然產物庫的擴充 511
參考文獻 532
第13章 後基因組時代的天然產物539
13.1 引言 539
13.2 利用生物信息學和計算來預測生物合成基因簇 544
13.3 膦酸酯類天然產物：基因組學能定義出完整的集合嗎？ 546
13.4 異源表達系統概述 550
13.5 途徑重構的精選實例 552
13.6 細菌基因組中基於生物信息學的天然產物發現 562
13.7 大腸桿菌中的異源表達 563
13.8 利用代謝工程產生多樣化產物 566
13.9 採用即插即用的方法從細菌克隆轉錄沉默的未知功能基因簇 569
13.10 後基因組時代的比較代謝組學 571
參考文獻 574
主題詞索引 578
