基於翻譯起始機制的原核基因組比較的生物信息學研究

科研成果

序號	標題	類型	作者
1	Prediction of translation initiation site for microbial genomes with TriTISA	期刊論文	Hu, Gang-Qing\|Zheng, Xiaobin\|Zhu, Huai-Qiu\|She, Zhen-Su\|
2	Water dynamics clue to key residues in protein folding	期刊論文	Zhu, Huaiqiu\|Yao, Xin-Qiu\|Gao, Meng\|She, Zhen-Su\|
3	New Solutions of Translation Initiation Site Prediction for Prokaryotic Genomes	期刊論文	She Zhen-Su\|Zhu Huai-Qiu\|Meng Xiao-Bin\|Yang Yi-Fan\|Liu Yong-Chu\|Hu Gang-Qing\|
4	Computational evaluation of TIS annotation for prokaryotic genomes	期刊論文	Zhu, Huaiqiu\|Zheng, Xiaobin\|Ju, Li-Ning\|Hu, Gang-Qing\|She, Zhen-Su\|
5	Water-protein interplay reveals the specificity of alpha-lytic protease	期刊論文	Zhu, Huaiqiu\|Yao, Xin-Qiu\|She, Zhen-Su\|Kang, Hong\|
6	基於剪接信號和調節元件序列特徵的剪接位點預測方法	期刊論文	朱懷球\|孫宗曉\|桑凌潔\|居理寧\|
7	致病性大腸桿菌UPEC CFT073全基因組分析及致病機制的新認識	期刊論文	胡鋼清\|羅成偉\|朱懷球\|
8	Genome reannotation of Escherichia coli CFT073 with new insights into virulence	期刊論文	Hu, Gang-Qing\|Luo, Chengwei\|Zhu, Huaiqiu\|
9	MetaTISA: Metagenomic Translation Initiation Site Annotator for improving gene start prediction	期刊論文	Zhu, Huaiqiu\|Liu, Yong-Chu\|Guo, Jiang-Tao\|Hu, Gang-Qing\|
10	A new method for splice site prediction based on the sequence patterns of splicing signals and regulatory elements	期刊論文	Sun ZongXiao\|Zhu HuaiQiu\|Ju LiNing\|Sang LingJie\|
11	Intermediate Structure and Slow Hydration Water Dynamics in Protein Folding Process	期刊論文	Zhu Huai-Qiu\|Gao Meng\|Yao Xin-Qiu\|She Zhen-Su\|Liu Zhi-Rong\|
12	ProTISA: a comprehensive resource for translation initiation site annotation in prokaryotic genomes	期刊論文	Yang, Yi-Fan\|Hu, Gang-Qing\|Zhu, Huaiqiu\|She, Zhen-Su\|Zheng, Xiaobin\|Ortet, Philippe\|

項目摘要

以原核基因翻譯起始機制為主要研究對象，發展刻畫翻譯起始位點及相鄰序列的統計模型、基於機率統計的數學模型，致力於發展原核生物（細菌和古細菌）比較基因組學的新方法和新工具，在全基因組水平、全部基因、部分基因（如橫向轉移基因、Essential基因）以及基因在基因組上的排列關係（如操縱子結構）和功能分類等幾個層次進行原核生物基因組的比較研究，著重選取一批具有物種分類代表性的細菌和古細菌基因組進行詳盡研究，同時大規模分析已完成全基因組測序和注釋的全部物種。進一步研究原核基因翻譯起始機制的物種特異性和進化動力學機制，探討翻譯起始機制在原核生物基因組演化過程中的作用。

基於翻譯起始機制的原核基因組比較的生物信息學研究

基本介紹

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