基因關聯(epistasis)是一個生物學名詞,對於某個基因為特定的等位基因,而其他基因取不同的等位基因時,生物體將表現出不同的物理性狀。
基本介紹
- 中文名:基因關聯
- 屬性:生物學名詞
基因關聯(epistasis)是一個生物學名詞,對於某個基因為特定的等位基因,而其他基因取不同的等位基因時,生物體將表現出不同的物理性狀。
基因關聯(epistasis)是一個生物學名詞,對於某個基因為特定的等位基因,而其他基因取不同的等位基因時,生物體將表現出不同的物理性狀。某個基因的特定等位基因對於生物體呈現為某種性狀可盲目起到促進作用,也可能起到抑制作...
全基因組關聯分析(Genome-wide association study)是指在人類全基因組範圍內找出存在的序列變異,即單核苷酸多態性(SNP),從中篩選出與疾病相關的SNPs。研究歷史 2005年,Science雜誌報導了第一項具有年齡相關性的黃斑變性GWAS研究[1]。之後陸續出現了有關冠心病[2]、肥胖[3][4][5]、2型糖尿病[6][7][8]...
全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)是指在全基因組層面上,開展多中心、大樣本、反覆驗證的基因與疾病的關聯研究,是通過對大規模的群體DNA樣本進行全基因組高密度遺傳標記(如SNP或CNV等)分型,從而尋找與複雜疾病相關的遺傳因素的研究方法,全面揭示疾病發生、發展與治療相關的遺傳基因。簡介 ...
《人類基因關聯分析的若干問題》是依託中國科學技術大學,由張洪擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 人類複雜遺傳疾病一般受多個基因、環境因素、基因-基因互動效應、基因-環境互動效應的影響,這給利用統計方法尋找致病因素帶來很大的挑戰。基於群體數據 (如病例-對照設計) 的關聯分析是尋找致病基因的最常用的統計...
《基於集成異構網路的表型-基因關聯挖掘研究》是依託南開大學,由謝茂強擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 表型-基因關聯預測和分析在疾病治療、食物增產等方面具有重大意義,是生物信息學中的核心問題,在全基因組網路上採用類似於PageRank的隨機遊走方法逐漸成為主流.但傳統方法只能在單個基因網路上進行挖掘,在對...
基因(遺傳因子)是產生一條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持著生命的基本構造和性能。儲存著生命的種族、血型、孕育、生長、凋亡等過程的全部信息。環境和遺傳的互相依賴,演繹著生命的繁衍、細胞分裂和蛋白質合成等重要生理過程。生物體的生、長、衰、病、老、死等一切生命現象都與基因有關。它也是...
《稀疏全基因組關聯分析方法研究》是依託中山大學,由王學欽擔任項目負責人的數學天元基金項目。中文摘要 全基因組關聯分析是在不作任何生物功能的前提假設下,對全基因組水平上的幾百萬個遺傳變異進行無偏倚的全面篩查,尋找出與複雜疾病的某些性狀相關的多個基因組合,並闡明它們之間的互動作用。這是研究複雜疾病的遺傳...
《基於網路的全基因組關聯分析方法》是鄧明華為項目負責人,北京大學為依託單位的面上項目。科研成果 項目摘要 認識人類疾病的遺傳基礎、發現遺傳變異導致疾病的生物機制是人類健康的關鍵。全基因組關聯分析(GWAS)旨在檢測人群中的複雜性狀與基因組上的突變位點之間的關聯。表達數量性狀(eQTL)分析是將基因表達量作為數量...
《孤獨症全基因組關聯第二階段研究》是依託北京大學,由王力芳擔任負責人的面上項目。項目摘要 孤獨症是一種起病於嬰幼兒期的神經發育障礙。研究提示遺傳因素在該病發病中起重要作用。孤獨症全基因組關聯研究(GWAS)克服了候選基因策略的局限性,有助於從全基因組水平發現新的易感基因。由於種族遺傳異質性,亟待開展...
《精神分裂症全基因組關聯研究的通路分析及驗證》是依託北京大學,由岳偉華擔任負責人的面上項目。項目摘要 近年來,採用高通量單核苷酸多態性(SNP)晶片檢測技術進行全基因組關聯研究(GWAS),已成為探索精神分裂症等複雜疾病易感基因的有效策略,而基於GWAS數據的通路(pathway)分析也逐漸成為國際上複雜疾病遺傳研究的熱點...
另外,多重檢驗問題、群體分層、基因型測量誤差等一系列與互動作用相關的問題也在我們的研究範圍中。本項目既有重要的生物醫學實際背景,也有統計理論和方法上的創新性,可引發一系列後續研究。結題摘要 本項目研究複雜疾病基因關聯分析中的互動作用分析方法。複雜疾病如糖尿病、高血壓、心臟病等與多個基因和環境因素有...
《全基因組關聯分析基因互動作用探測算法研究》是依託湖南師範大學,由謝民主擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 受計算資源和算法效率的制約,作為探索複雜疾病遺傳機制有力手段的全基因組關聯分析(GWAS)目前主要局限於單位點分析方法。可複雜疾病是基因-基因、基因-環境互動作用的結果,全基因組關聯分析亟需高效多...
但此種背景下形成的姓氏傳遞,很難尋找到與遺傳基因的關聯。中國人的姓氏卻完全不同。有著五千年文明史的中國,是世界最早使用姓的國家,大約在五千年前的伏羲氏時代,姓就被定為世襲,由父系傳遞;受宗法制度的持續影響,幾千年歷史中,祭祀祖宗,不斷煙火,成了家族的頭等大事。尤其在漢族社會中,宗族觀念根深...
我們進一步對531例惡性膠質瘤的affymetry SNP-CHIP數位化染色體型圖譜進行了整合分析,探索可能存在的EGFR的相關聯的基因。並且我們的研究結果揭示了:(1)EGFR擴增與1p36.23 片段缺失同時發生的患者與單獨EGFR擴增或單獨1p36.23 片段缺失相比生存時間最短;(2)EGFR受轉錄因子YY1的轉錄活化,mir-34a通過靶...
本項目研究以單體型為基本單位的基因關聯分析,包括利用群體中單體型的稀疏性研究單體型頻率估計的壓縮感知規則化算法;基於LD係數矩陣或複合LD係數矩陣主要特徵在病例組和對照組之間的差異,構建互動作用分析方法;基於回溯型似然函式,通過組合劃分方法降低參數空間維數,研究以單體型為基礎的高效檢驗方法;利用下一代測序技術提供...
《通過全基因組關聯分析發掘水稻雜種優勢相關基因》是依託中國農業大學,由張洪亮擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 雜種優勢機理和預測方法的研究經歷了上百年,由於尚不知道有多少基因以及哪些基因與雜種優勢相關,雜種優勢機理仍沒有得到充分解釋,雜種親本的選配仍存在一定的盲目性和運氣成分。中國是最早利用水稻雜種...
目前最為流行的複雜疾病研究手段是基於單個位點的全基因組關聯分析。由於複雜疾病的發病機制十分複雜,往往是由多個位點共同作用而導致的, 所以相當部分單個位點的作用可能很微弱以致很難被全基因組關聯分析所發現。因此, 對於基因-基因相互作用的分析是一種潛在的解決方法。研究方法 核酸適體技術 核酸適體(aptamer)指的...
(一)雙相障礙基因多態性關聯研究 研究背景:我們通過收集雙相障礙患者的DNA來檢測基因的多態性,希望發現雙相障礙的疾病生物標誌物。 研究內容:通過關聯分析的方法,更有效的發現基因多態性位點,首先選取典型病例,採用基因測序的方法,篩查出差異基因。然後再根據篩查的差異基因的數量,採用高通量或低通量的檢測SNPs的...
《農藝性狀及相關基因關聯網路若干基礎問題研究》是依託吉林大學,由梁艷春擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 農藝性狀是人們在農業生產中最關心的問題之一,而構建與分析農作物基因和農藝性狀關係的複雜網路,是目前農作物基因組學研究的前沿和熱點問題。本課題在蒐集農作物基因晶片數據的基礎上,研究基因表達數據噪聲...
《誠信缺失行為個體差異的基因關聯與神經機制研究》是依託深圳大學,由劉金婷擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 當前中國社會的誠信狀況並不樂觀。詐欺案件逐年大幅增多。申請人的前期工作表明,誠信缺失是一種穩定的特質,且存在巨大的個體差異。雙生子研究發現,誠信缺失的特質性差異約有25-50%可歸因於遺傳...
《多性狀全基因組關聯分析新方法的探索》是張瑾為項目負責人,南京農業大學為依託單位的青年科學基金項目。項目摘要 由於人工選擇的品種群體構建時間短、SNP標記密度高和利用歷史重組機會多,致使近年來關聯分析在植物遺傳研究中套用較為廣泛。但是,目前的分析方法一般採用單性狀分析,假陽性率較高,功效有待提高。研究已...
新近的研究顯示,JAK/STAT信號通路相關基因遺傳變異與肥胖的發生密切相關。本項目擬採用流行病學病例對照與遺傳學家系相結合的研究設計,在中國漢族肥胖和對照家系人群中探討JAK/STAT信號通路LEP-R、JAK2、STAT3基因SNPs位點及單倍體型的人群分布特徵;分析相關基因型與肥胖遺傳易感性的關聯強度;聯合套用多...
《基於全基因組關聯分析的遺傳調控網路構建算法研究》是依託哈爾濱工業大學,由劉曉燕擔任項目負責人的重大研究計畫。項目摘要 解析農作物產量性狀相關的遺傳構成和調控機制是提高糧食單產的重要基礎,本項目從生物信息學角度,針對影響主要性狀的關鍵基因發現問題,發展全基因組關聯分析(GWAS)的有效算法,並研究面向多數據...
《棉花黃萎病抗性相關基因的關聯分析與發掘》是依託中國農業大學,由劉文欣擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 棉花是我國重要的經濟作物,日益嚴重的黃萎病已對我國棉花生產和國民經濟構成極大威脅。本項目從包含豐富抗病基因資源的棉花品種資源群體中,通過比較基因組學和分子生物學技術確定候選基因作為靶心標記,...
《面向全基因組關聯研究的動態數據挖掘與深度查詢方法》是依託中南大學,由裘嶸擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 本項目針對全基因組關聯研究 (Genome-wide association studies, GWAS) 的Deep Web數據量大、信息更新不定期、更新數據比例小、內容專題性強等特點,提出一種面向GWAS的動態數據挖掘與深度查詢...
擬等位基因 表型效應相似,功能密切相關,在染色體上的位置又緊密連鎖的基因。它們像是等位基因,而實際不是等位基因。復等位基因 若同源染色體上同一位置上的等位基因的數目在兩個以上,就稱為復等位基因(multiple allelism)。任何一個雜合的二倍體個體只存在復等位基因中的二個不同的等位基因。關聯內容 野生型和...
《矩陣分解在基因組關聯研究中的套用》是依託復旦大學,由張淑芹擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 基因組關聯性的研究是近年來剛興起的課題,它主要通過研究基因組中的某些基因標記與疾病的關聯性,從而來研究某些基因與疾病的聯繫。本項目研究矩陣分解在基因組關聯中的套用,主要通過研究病人和常人的基因標記...
人們對有性生殖過程中基因的整體行為已有相當精準的認識,也潛在意識到種群基因庫作為一個整體存在的適應意義。有學者從基因庫的視角詮釋了物種的形成機制:1)絕大多數真核生物物種的基因庫(所有個體的基因及其組合與關聯方式)通過有性生殖(減數分裂、兩性配子的融合)流動性地保存於整個群體之中,因此,物種的遺傳...
LD,Linkage disequilibrium的簡稱,指連鎖不平衡分析,在連鎖不平衡程度的評估,複雜疾病精細定位以及研究人類的歷史和遷移中得到了廣泛的套用。釋義 連鎖不平衡(Linkage disequilibrium)分析在連鎖不平衡程度的評估,複雜疾病精細定位以及研究人類的歷史和遷移中得到了越來越廣泛的套用。連鎖不平衡又稱等位基因關聯(allelic ...