基因間隔區

基因間隔區/基因間區（intergenic region），它不為胺基酸編碼，長短不一，短的僅幾個核苷酸。在真核生物中它可能包含一些調控序列

基本介紹

• 中文名：基因間隔區
• 外文名：intergenic region
• 縮寫：IGR

定義

基因間隔區（IGR）是位於基因與基因之間的一段DNA序列。IGR的少數序列會影響基因的表現，偶爾有一些可以控制其附近的基因，但大部分都沒有已知的功能。它有時亦被稱為垃圾DNA。最近從IGR的DNA片段轉錄成的RNA被稱為“暗物質”或“暗物質轉錄物”。

特性

IGR不同於在基因編碼區的內含子，它是高頻存在於在生物，尤其真核生物的非編碼區的短DNA序列，在人類基因組中占大多數。

根據DNA元件百科全書計畫（ENCODE）對人類基因組的研究，通過發現新異構體擴大基因區域和鑑定新的基因間隔區轉錄本，基因間區域的數量顯著增加（從32,481到60,250）。 科學家已經根據基因間區域人工合成了蛋白質。

功能

因為IGR沒有功能所以它曾被稱為垃圾DNA。然而，近些年來發現這些區域確實含有功能上重要的元件，例如啟動子和增強子。特別地，基因間隔區含有的增強子DNA序列，其可以對幾千個鹼基對以外的的距離上的離散基因進行激活表達。改變與增強子結合的蛋白質會導致基因表達重調並影響細胞表型。基因間區域也可能包含尚未鑑定的基因，如非編碼RNA。雖然對它們暫時知之甚少，但它們被認為具有調節功能。特別是在人類基因組中，它占比將近95%，而在細菌與酵母中，它的比例很低，只有15%-30%。近年來，隨著ENCODE項目的進展，人類的基因間區域正在被更詳細的研究。