《基因多態位點預測雲南非小細胞肺癌預後風險研究》是依託雲南大學，由肖春傑擔任負責人的國家自然科學基金專項基金項目。
基本介紹
- 中文名：基因多態位點預測雲南非小細胞肺癌預後風險研究
- 負責人：肖春傑
- 依託單位：雲南大學
- 項目類型：專項基金項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
中國肺癌死亡率已居各種腫瘤的首位。非小細胞肺癌患者五年生存率僅為16%。早期術後患者僅依據TNM分期進行治療存在治療不足或過度治療的風險，而迄今從基因水平對這類患者進行預後風險預測方法尚未建立。鑒於此，本項目將充分利用雲南肺癌高發的樣本資源優勢，採用回顧性佇列研究方法，收集近5年雲南非小細胞肺癌病理石蠟切片300份，並對患者進行隨訪；針對文獻報導通過全基因組關聯分析獲得的44個多態位點進行基因分型及單倍型構建，比較不同人群間相同基因位點數據，揭示其易感位點的差異及遺傳特徵；利用生存分析系統及Cox風險評估系統對上述SNPs位點進行評估, 建立針對雲南非小細胞肺癌I期、II期患者預後風險預測的多基因聯合檢測新方法，有助於制定早期肺癌患者術後治療最佳方案，提高診斷效率、治療效應及患者生存期, 具有臨床指導意義。
結題摘要
非小細胞肺癌(NSCLC)是一種常見惡性腫瘤，迄今從基因水平對早期術後患者進行預後風險預測的方法尚未建立。項目組利用雲南肺癌高發的樣本資源優勢，採集NSCLC石蠟包埋切片、新鮮組織和血液樣本，開展流行病學資料收集、整理及分析，並對患者進行隨訪。對全基因組關聯分析獲得的44個多態位點進行基因分型及單倍型構建，發現僅有基因EYA2和STK39多態位點與NSCLC發生相關。EYA2基因7個位點基因型（rs11699842AA、rs13039645TT、rs1150441TT、rs1150442CT/CC、rs13041757GA/AA、rs11697925GG、rs6066146CC）增加患病風險，而3個位點基因型（rs6066146CT、rs11696413AA/AC、rs13041611CT）降低患病風險；單倍型ATCCAAATCGCTG、TCTTCAACTGCTG和TCTTCAATTGCTA增加患病風險，而單倍型TCCCCGATCGCTG、TCCTCGACCGCTG和TCCTCGATCGCTG降低風險。STK39基因rs1829227AA/GA基因型增加患病風險,而rs10198473CT/TT降低患病風險； ATTT單倍型增加患病風險。 根據國際疾病基因研究最新趨勢，在完成44個多態位點基因分型及單倍型構建的同時，增加了基因功能研究發現：1、EYA2蛋白高表達具有促癌作用，其CpG島甲基化狀態與miR-30a表達情況均影響EYA2蛋白表達水平，繼而影響NSCLC細胞增殖、遷移和侵襲等生物學行為。2、GCNT3表達顯著上調，敲低GCNT3後顯著抑制了NSCLC細胞的增殖、遷移和侵襲能力，阻滯細胞周期進程，促進細胞凋亡。3、miRNA-320a在肝癌組織表達水平下調，而長鏈非編碼RNA-AK091631在大腸癌組織的表達水平明顯下調；miR-320a能通過調控c-Myc表達從而有效降低肝癌細胞系的增殖和侵襲能力，而RNA-AK091631作為抑癌基因可以通過調控WNT/β-catenin信號通路從而影響結直腸癌的發生。 本項目通過關聯分析與機制探索相結合的研究策略，得到與NSCLC發生相關的3個易感基因，有可能成為NSCLC的診療和預後檢測的新指標。項目成果發表SCI論文4篇，在投2篇；3人獲博士學位、7人獲碩士學位。
