《噬菌體感染細菌調控網路的構建與分析》是依託電子科技大學,由丁輝擔任醒目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：噬菌體感染細菌調控網路的構建與分析
- 依託單位：電子科技大學
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：丁輝
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
從非線性動力學和非平衡熱力學角度研究生物體的非線性自組織現象是重要的前沿科學問題。本項目擬對被噬菌體感染的細菌溶源/裂解調控網路進行系統的研究。首先，我們擬從動力學角度，利用非線性微分方程對被Lambda噬菌體感染的大腸桿菌調控網路進行建模，重點研究調控早期蛋白對感染到溶源態建立的調控機制，和CII、CIII、Q、N蛋白對溶源/裂解調控的影響；其次，擬從熱力學角度，對該調控網路的熱力學熵和熵產生率進行研究，給出網路穩態和熱力學基礎；最後，將模型推廣到其它類型噬菌體侵染細菌的調控網路，並比較不同網路的調控機制。通過以上研究，將建立一套研究相關調控網路的模型，並揭示噬菌體侵染細菌選擇不同生存途徑的調控機制。該項目的實施對定性、定量研究基因調控網路具有重要的科學意義。
結題摘要
從非線性動力學和非平衡熱力學角度研究生物體的非線性自組織現象是重要的前沿科學問題。本項目擬對被噬菌體感染的細菌溶源/裂解調控網路進行系統的研究。首先，我們從動力學角度，利用非線性微分方程對被 Lambda 噬菌體感染的大腸桿菌調控網路進行建模，重點研究調控早期蛋白對“感染”到“溶源態”建立的調控機制；其次，從熱力學角度，對該調控網路的熱力學熵進行研究，給出網路穩態和熱力學基礎；最後，將模型推廣到突變型噬菌體侵染細菌的調控網路，並比較了不同網路的調控機制。此外，基於機器學習算法，我們構建了預測模型來識別噬菌體特殊功能蛋白，並推廣到其它蛋白質和DNA調控元件的識別中。該項目的實施對定性、定量研究基因調控網路具有重要的科學意義。
