《同一個體食管/賁門雙源癌組織DNA甲基化檢測》是依託鄭州大學，由王立東擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：同一個體食管/賁門雙源癌組織DNA甲基化檢測
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：王立東
- 依託單位：鄭州大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
河南林州是世界上食管和賁門癌發病率和死亡率最高的地區。本項目組95年至今在該地區建立現場研究基地進行人群普查和隨訪，發現該地區同一個體，同時發生食管鱗狀細胞癌和賁門腺癌（簡稱食管/賁門雙源癌）的患者並非罕見（2.5-5%），並已積累臨床資料齊全的100例食管/賁門雙源癌組織標本。雙源癌發生在同一個體，遺傳背景和環境因素相似，對比分析食管/賁門雙源癌患者食管癌和賁門癌甲基化差異對闡明環境和遺傳因素對食管和賁門癌發生的影響具有重要意義。因此，本項目一改以往孤立的從單發食管和賁門癌進行癌變機理研究的思路，採用美國Operon公司DNA甲基化晶片（含1萬個基因），檢測河南林州地區同一個體食管/賁門雙源癌患者外周血和組織中DNA甲基化差異，初步確定食管/賁門雙源癌甲基化譜，並與同一地區不同個體單發食管癌和單發賁門癌甲基化譜進行對比分析，為進一步建立高危人群篩查和早期診斷的甲基化標誌物奠定基礎。
結題摘要
本項目實施3年，超額完成申請書各項研究計畫：新增551例食管/賁門雙源癌臨床信息及生物樣品（原計畫200例），已達1106例；完成625例患者5年生存隨訪（原計畫400例）；完成60對食管/賁門雙源癌患者甲基化晶片（Human Methylation 450K）檢測和40例全基因組甲基化測序。研究發現：1.雙源癌患者5年生存率明顯低於單發食管癌（P ＜0.05，HR=1.976，95%CI=1.344-2.904）和單發賁門癌（P＜0.05，HR=2.652，95%CI=1.501-4.687），性別、淋巴結轉移和家族史是影響雙源癌預後的獨立因素；2.利用全基因組甲基化測序共得到77個可能和雙源癌變相關的甲基化位點，其中4個位於啟動子區（P＜0.001）。 一、本項目預定研究內容： 1、雙源癌標本庫擴充和完善，包括： (1)新收集200例食管/賁門雙源癌患者臨床信息及生物樣品； (2)成功隨訪400例雙源癌患者。 2、甲基化檢測： 完成60對食管/賁門雙源癌和正常對照人群DNA甲基化晶片檢測。 二、本項目研究目標: 1、擴充、完善食管/賁門雙源癌患者臨床信息及生物樣品資料庫； 2、甄別食管/賁門雙源癌變關鍵甲基化位點，為進一步建立高危人群篩查和早期診斷的甲基化標誌物奠定基礎。 三、項目執行完成情況： 1、雙源癌標本庫建設和完善： (1) 食管/賁門雙源癌患者臨床信息和生物樣品由551例增至1106例（新增565例，計畫200例）； (2) 完成食管/賁門雙源癌患者隨訪625例，超過原計畫的400例。 2、甲基化檢測： 使用Human Methylation 450K甲基化晶片（包含大於45萬個甲基化位點）檢測60對食管/賁門雙源癌患者及正常對照人群外周血DNA甲基化位點，找到14個與雙源癌變相關的甲基化位點（P＜0.05），且該14個位點包含在全基因組甲基化測序找到的77個雙源癌變相關甲基化位點裡面；採用全基因組甲基化測序技術對20例雙源癌和20例正常人群外周血DNA進行測序，找到77個可能和雙源癌變高度相關的甲基化位點，其中4個位於啟動子區（P ＜0.001），他們分別為：Chr15:75720845，Chr6:108989248，Chr6:108989257，ChrX:84076055。
