《口腔變異鏈球菌srtA基因功能的代謝組學研究》是依託四川大學，由鄒玲擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：口腔變異鏈球菌srtA基因功能的代謝組學研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：鄒玲
- 依託單位：四川大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
齲病是嚴重危害人類健康的三大疾病之一，其主要致齲菌－變異鏈球菌毒力基因的研究對於闡明齲病的發病機制極為重要。轉肽酶A(srtA)在調節變鏈菌表面特性和致齲性中起重要的作用。目前基因組學和蛋白質組學的研究方法不能闡明其實驗數據與細菌表型之間的關係，而細胞內的全部代謝物最接近於表型，因此代謝組學技術為致齲菌基因功能研究的深入提供了全新的思路和切入點。本研究擬從基因、蛋白質、代謝物及表型差異分析等角度縱向研究變異鏈球菌srtA的作用過程和調控機理。通過構建srtA基因的突變株和野生株模型，以核磁共振和質譜檢測為技術平台的代謝組學方法，描繪srtA基因沉默後引起的代謝變化指紋圖，並通過該譜圖的分析，尋找其標誌性代謝產物與srtA基因的相關性，篩選與致齲性相關的代謝物靶標，從分子機理上闡明致齲基因srtA的調控機制。並為今後建立齲病早期預防、診斷和干預的專家系統奠定良好的基礎。
結題摘要
基於變異鏈球菌srtA 基因在細菌黏附與聚集過程中發揮的關鍵作用，它可能是齲病預防的一個新目標。本項目通過成功構建口腔變異鏈球菌轉肽酶A（SrtA）基因缺陷株，採用高分辨核磁共振波譜法和高效氣相色譜-質譜儀採集野生株和突變株胞外、胞內代謝物譜圖數據，並用NMR、MS 相關的波譜學方法及專家系統對胞外、胞內特徵性代謝組進行成分確定。結果發現，野生株和突變株胞外、胞內代謝物都處於95%置信區間（Hotelling T2 ellipse）內，不同分組基本能聚集在一起。從2D和3D主成分得分圖可以看到，PCA圖是對原始數據的一個反應，已經基本可以將四組區分開來，各生物學重複能明顯聚集在一起，有很好的重現性，有些組區分不明顯的可以通過之後的判別分析進一步研究其差異。分析得到有差異的代謝物包括：花生酸、3,6-脫水-D-半乳糖、5-甲氧基色胺、十七烷酸等一組差異代謝物。下一步研究中將這些代謝信息與病理生理過程中的生物學事件關聯起來，以確定發生這些變化的靶器官和作用位點，進而確定相關的生物標誌物，為醫療干預提供新的標記和位點，為闡明齲病發病機制提供新的實驗依據。
