亦稱“厭氧細菌”。在生命活動中不需要氧氣而進行無氧呼吸的細菌。只在無氧的環境中活動,氧氣對其具有毒害作用。根據對氧氣的耐性不同,又可分為專性厭氧菌和耐氧性厭氧菌。前者只能在無氧條件下才能生長,一遇到氧氣就死亡,如產甲烷菌、梭狀芽孢桿菌屬、擬桿菌屬、脫硫弧菌屬等。後者對氧的存在不敏感,但不能利用氧進行能量代謝,如大多數乳酸菌。