原核生物中DNA同源重組在進化中的作用

原核生物中DNA同源重組在進化中的作用

《原核生物中DNA同源重組在進化中的作用》是依託南京大學,由王強擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:原核生物中DNA同源重組在進化中的作用
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:王強
  • 依託單位:南京大學
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

在進化機制上,雖然真核生物與原核生物有很多相似之處,但兩者在重組方面存在巨大的差異。傳統上認為,真核生物的進化主要是通過同源重組修改現存的遺傳信息,而原核生物則主要通過水平基因轉移,從遠緣物種獲得序列並整合到自身基因組中。近十五年來積累的群體遺傳學數據表明,原核生物同源重組是常規事件,而非例外的現象。但是由於實驗方法、信息處理等方面的缺憾,原核生物同源重組對進化的影響程度尚不清楚。我們的前期研究在方法學上進行了突破性的創新,有跡象顯示同源重組在原核生物進化中起著重要作用,其作用強度可以達到異交哺乳動物的水平。現已收集整理六千多個菌株的全基因組數據,共覆蓋近2600個種,其中157個物種可用於分析全基因組水平上的同源重組事件。本項目以大量原核生物的全基因組數據為樣本,分析同源重組事件,以回答原核生物中同源重組對進化的作用強度有多大這一科學問題,並分析影響原核生物同源重組的因素。

結題摘要

本項目以大量原核生物的全基因組數據為樣本,分析同源重組事件,回答了“原核生物中同源重組對進化的作用強度有多大”這一科學問題,並分析影響原核生物同源重組的因素。將研究成果就用於臨床檢驗,開展了“ICU重症肺炎病原菌快速鑑定”研究。實施過程中,產生了大量的原創性的生物信息學技術與方法,這些方法除了套用於本項目 的主要研究目標之外,同時也可以作為精準醫療的基礎方法。

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