2016年7月在江蘇省委宣傳部的支持和指導下，南京醫科大學申報組建了健康江蘇建設與發展研究院，成為江蘇省重點培育智庫，是江蘇省衛生與健康領域唯一的智庫建設單位。南京醫科大學健康江蘇建設與發展研究院現由南京醫科大學黨委書記王長青領銜，協同江蘇省衛生計生委、南京醫科大學相關部門和附屬醫院、兄弟院校以及國際組織，以“健康江蘇”建設中的現實問題開展理論和政策研究。
南京醫科大學健康江蘇建設與發展研究院聚焦“健康中國”、“健康江蘇”建設與發展，圍繞民眾健康需求增長、工業化、城鎮化、人口老齡化、疾病譜和生活方式變化等問題進行長期跟蹤研究，為江蘇省不斷提升醫療衛生服務能力、著力深化醫藥衛生體制機制改革、進一步強化健康教育與健康促進、培養全民健康意識和健康生活方式、加快推進城鄉健康養老服務、創新發展健康服務業，提供政策決策諮詢和智力支持。
2018年9月，經江蘇省新型智庫建設工作領導小組辦公室同意備案，將南京醫科大學健康江蘇建設與發展研究院的中英文名稱一併進行更改，原名為健康江蘇建設與發展研究院（Institute of Healthy Jiangsu Construction and Development），現更名為健康江蘇研究院(Institute of Healthy Jiangsu Development）。
