《動物數量性狀候選基因單倍體型分析方法及其套用研究》是依託上海交通大學,由潘玉春擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:動物數量性狀候選基因單倍體型分析方法及其套用研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:潘玉春
- 依託單位:上海交通大學
- 批准號:30671492
- 申請代碼:C1702
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2007-01-01 至 2009-12-31
- 支持經費:28(萬元)
項目摘要
動物數量性狀候選基因分析存在很多問題:一是一個候選基因中可能有多個多態位點;二是多個候選基因可能同時影響一個性狀;三是因為一個性狀可能涉及眾多基因且易受環境影響而使一個基因效應較小、難以檢測;四是候選基因在被用於輔助選擇或保種時缺乏可操作性,尤其是在存在多個基因、每個基因又有多個多態位點時。目前,在人類基因組研究中,單倍體型分析已被運用到SNP位點與複雜疾病間的關聯分析中。然而,這種方法只能分析單個基因中或單條染色體區域內的SNPs,故不適於分散到多個基因和染色體上的動物數量性狀候選基因多態位點分析。據此,我們擬創造性地提出數量性狀單倍體型的分析方法,包括單倍體型檢測、單倍體域確定、單倍體型標籤SNP篩選、關聯分析、遺傳參數估計以及輔助保種與選擇等諸方面,通過模擬研究檢驗其有效性,並進而將其用到梅山豬繁殖性狀候選基因研究中去,既解決實際問題又驗證有關方法。