《兩核苷酸合成測序及其在PCR產物分析中的套用研究》是依託東南大學，由肖鵬峰擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：兩核苷酸合成測序及其在PCR產物分析中的套用研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：肖鵬峰
- 依託單位：東南大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
DNA測序技術是現代生命科學研究中重要的手段之一,是多學科交叉的前沿研究。本項目針對實時合成測序方法的不足，基於不同核苷酸合成反應產生完全相同的檢測分子的原理，提出適合第一代、二代和三代實時合成測序平台的兩核苷酸合成測序技術並進行系統研究。（1）通過最佳化兩核苷酸的循環合成測序的反應條件，大幅度增加測序技術的的閱讀長度和準確性，為現有高通量DNA實時測序平台提供一種新策略；（2）利用兩核苷酸合成測序長、具有信號放大，以及一次合成測序得到的信息由兩類編碼組成等特點，將這種基於具有唯一性的模式識別而非序列識別的合成測序技術套用到PCR產物的傳統焦測序檢測中，為疾病核酸分子標誌物，以及食品安全、公共衛生等領域的病毒和微生物的分析提供新途徑。開展兩核苷酸合成測序及其套用研究，對於發展新測序方法及其相關理論具有非常主要的套用價值和科學意義。
結題摘要
在本自然科學基金的資助下，本項目主要開展了以下研究工作：1、研究了兩核苷酸合成高通量DNA測序的可行性、特徵及其不足的應對策略，為兩核苷酸合成高通量DNA測序新策略提供了理論上支撐。2、研究了兩核苷酸合成在第一代焦測序平台上的套用，建立了比傳統單核苷酸焦定性分析測序長度更長、定量分析檢測限更低的兩核苷酸合成焦測序技術，可用於核酸遺傳分析。3、發展了基於兩核苷酸測序的新分析方法、拓廣了焦測序套用範圍：（a）提出一種單倍型定量分析方法；（b）提出一種單倍型定性分析方法；（c） 提出一種用於樣本與對照序列差異譜分析方法；（d）提出一種基於樣本組合分析多模板核酸序列的檢測方法。4、開展了“探索兩核苷酸合成測序新方法、及其套用新途徑”研究：（a）提出“新型兩核苷酸合成測序”策略、有望成為最準確的測序技術。（b）提出一種DNA存儲的寡核苷酸可變編碼方法，可對二進制檔案編碼成滿足要求的寡核苷酸序列。（c）研究“基於分析PCR副產物焦磷酸的特異PCR產物快速檢測方法“，核酸檢測限達到單個拷貝。本項目共發表SCI收錄期刊論文7篇、會議論文7篇；獲授權發明專利9項、申請5項；軟體著作權1件；培養碩士畢業研究生3人。
