《全基因組水平解析甘藍型油菜硫苷與菌核病抗性的關係》是依託西南大學，由魏大勇擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：全基因組水平解析甘藍型油菜硫苷與菌核病抗性的關係
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：魏大勇
- 依託單位：西南大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
由核盤菌引起的菌核病是危害我國油菜生產的主要病害之一。油菜等十字花科植物營養體的硫苷及其降解產物對核盤菌等病原微生物具有抗菌作用，因此研究影響菌核病抗性的硫苷基因對於油菜的抗菌核病育種具有重要意義。前期我們分別對甘藍和油菜極端抗病和感病材料進行了接種核盤菌前後的轉錄組測序，發現5個硫苷合成相關基因在所有材料中均受核盤菌誘導上調錶達。本項目將利用500份油菜自然群體的全基因組重測序數據，對上述5個硫苷合成相關基因進行變異位點的檢測，再結合菌核病抗性數據進行候選基因關聯分析，挖掘對抗性貢獻最大的候選基因及最佳單體型，最後通過超量表達和RNA干擾等實驗驗證候選基因的功能，並開發功能標記。本項目可一定程度闡明部分硫苷基因與菌核病抗性的關係，對於油菜抗菌核病分子育種有重要的實際意義。
結題摘要
次級代謝產物硫苷在油菜的抗病蟲方面起到重要作用，但目前油菜的種子硫苷含量較高，因此研究油菜種子的硫苷含量對抗病蟲育種具有重要意義。前期我們對307份不同生態型（春性、冬性和半冬性）的油菜進行全基因組重測序，並對多年多點的種子硫苷含量進行全基因組關聯分析，對其中的36份極端種子硫苷含量的材料進行轉錄組測序。結果顯示，在三個生態型油菜中，檢測到4個共同和4個特異的單體型塊與種子硫苷含量顯著相關。進一步的單體型分析、基因組變異分析和候選基因表達分析顯示，三個生態型中，鑑定到5個共有的候選基因，在春性材料中，鑑定到3個特定的候選基因與種子硫苷含量顯著相關。表達模型說明，候選基因的加性效應可以進一步的降低種子的硫苷含量，該研究對油菜種子低硫苷含量的研究具有重要的指導意義。
