2009年，中國科學院與江蘇省南京市人民政府共同簽訂了共建中國科學院南京高新技術研發與產業化中心。2010年1月23日中國科學院南京高新技術研發與產業化中心在南京市正式設立和並啟動運行。
中國科學院南京高新技術研發與產業化中心依託中國科學院和南京市雙方優勢，結合南京市產業發展特點和科技需求，以技術轉移和項目合作為基礎，以中國科學院院屬有關單位和南京市有關企業緊密合作為紐帶，構建面向南京市的研發與成果轉化平台，重點引進中國科學院具有重大套用前景的先進技術和成果與南京市企業對接或就地轉化，並有針對性地進行工程化開發、系統集成或二次研發，開展具有重大套用前景的關鍵或共性技術攻關，加快中國科學院科技成果在南京市轉移轉化和產業化，提升南京市企業的自主創新能力，立足南京，服務江蘇，輻射全國，成為中國科學院重要的技術轉移成果轉化載體。
中國科學院南京高新技術研發與產業化中心重點圍繞軟體、微電子、通訊、電力自動化、新能源、新材料、精細化工、生物醫藥等領域，以行業重大關鍵、共性技術攻關為主攻方向，組織中國科學院院屬研究所與南京市企業進行聯合攻關，組織協調院屬研究所與其他高校、科研機構聯合合作，為多學科的技術集成、終端產品的開發提供創新性解決方案，提升南京市產業、企業競爭力。
